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2006年01号~2007年01号少年無宿シンクロウ星野泰視、さいふうめい無法の風の只中に生きる少年・シンクロウ。博打寺に拾われて、仏の道と渡世の道を半々に聞きながら育つ。
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2006年10号~2006年49号街刃-GAIJIN-天辰公暸政府は忍術を規制する「特別区域法」を制定し、正義の忍者組織「特別区域機動隊」を設立した——。
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2006年14号~2006年23号池袋ウエストゲートパーク朝基まさし、石田衣良池袋に生きるエッジな若者体達の生と死を描く!!
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2006年18号~2006年28号Magnum ROSE HIP藤沢とおる
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2006年21/22合併号~連載中エリアの騎士漫画:月山可也、原作:伊賀大晃“U-15の天才エース”と呼ばれる兄・逢沢傑(あいざわ・すぐる)に憧れながらも、とある過去の呪縛によって、マネージャー職に「逃げ」てしまった元FWの駆(かける)。
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2006年23号~2006年49号スミレ♡16歳!!永吉たける四谷スミレは一見普通の女子高生。だけど、本当は謎のオヤジが操る腹話術人形だった!!※「マガジンSPECIAL」に移籍
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2006年24号~連載中ダイヤのA寺嶋裕二捕手・御幸一也との出会いが、少年の人生を一変させる。沢村栄純15歳。己の力を試すため、仲間に別れを告げ、野球名門校・青道の扉を叩く。
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2006年28号~2006年48号アイドルのあかほん氏家ト全中学生で言葉をよくかむシホ、小学生ながら芸歴9年のユーリ、高校生で一見大人しいカルナの3人は、「トリプルブッキング」というユニットで、アイドルとしてデビューすることに!!
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2006年29号~2006年52号格闘料理人ムサシ刃森尊宮本ムサシ17歳。喧嘩は弱いが、味バトルにはめっぽう強い!?
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2006年33号~2010年20号スマッシュ!咲香里青春バドミントン・ラブストーリー!
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2006年35号~連載中FAIRY TAIL真島ヒロ魔法界一のお騒がせ集団が巻き起こすめちゃおもしろ冒険ファンタジー!
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2006年36/37合併号~2011年04/05合併号新約「巨人の星」花形村上よしゆき、梶原一騎・川崎のぼる天才投手と呼ばれリトルリーグで名を挙げてきた花形満。しかし、周囲の期待からケガを言い出すことができずに肩を壊してしまう。絶望の縁で花形が掴んだのは、打者という選択だった!!
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2006年38号~2008年19号未来町内会野中英次時は2076年!主人公は町の電気屋さん!その男が町内会長になったために巻き起こる、どーでもいい数々の人間ドラマ!
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2006年43号~2007年08号仮面ライダーをつくった男たち村枝賢一国民的ヒーロー番組『仮面ライダー』創造に情熱を注いだ、汗と泥にまみれた熱き男たちの物語——!!
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2006年46号~2011年25号ヤンキー君とメガネちゃん吉河美希学級委員長として奮闘する元ヤンキー娘・花と、それに振り回される現ヤンキー・品川の学園タンデムコメディ!!
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2006年50号~2009年02/03合併号ハンマーセッション!棚橋なもしろ、小金丸大和→八津弘幸極悪犯を乗せた護送車が追突事故にあった。それに乗じ、脱走したひとりの第一級詐欺師。彼はひょんなことから中学校の教師を演じることになった!
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2006年52号~2007年10号マグロ一本釣り伝説 じょっぱれ瞬!若松浩、佐々木善章背負った借金3千万円——!?ある日突然、父親が作った借金を抱えることになった小泉 瞬!こうなったら一攫千金を狙ってマグロを釣るしかない!!めざすは青森・大間! 巨大マグロ漁に挑戦だ!!
週刊少年マガジン - 2006年
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