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2006年01号~2012年38号範馬刃牙板垣恵介
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2006年04/05号~2008年28号24のひとみ倉島圭
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2006年04/05号~2007年14号涅槃姫みどろ漫画:中里宣、原作:大西祥平
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2006年06号~2007年39号ゾクセイ松山せいじ
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2006年09号~2009年04/05号現代怪奇絵巻根本尚
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2006年01号~2008年29号Dämons漫画:米原秀幸、原作:手塚治虫
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2006年15号~2012年39号みつどもえ桜井のりお※当初は短期集中連載。2006年41号から本格連載化。2011年20号~2012年34号まで長期休載。『別冊少年チャンピオン』に移籍
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2006年16号~2007年22/23号無敵看板娘N佐渡川準
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2006年18号~2007年33号椿ナイトクラブ哲弘(現:丸山哲弘)
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2006年02号~2007年01号キレルくん五島慶彰
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2006年21号~2007年52号ペンギン娘高橋てつや※『チャンピオンRED』へ「ペンギン娘MAX」と改題して移籍
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2006年21号~2006年52号星のブンガ細川雅巳
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2006年03号~2007年01号クンクンカムカ沼田純※2006年19号、20号は読切掲載
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2006年03号~2007年34号アイホシモドキ森繁拓真※33号まで短期集中連載。2007年01号より本格連載化
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2006年33号~2007年01号発明軍人 イッシン阿部秀司
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2006年33号~2008年35号ヤンキーフィギュアミッチェル田中※36/37号まで短期集中連載。52号読切掲載。2007年31号より本格連載化
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2006年36/37号~連載中聖闘士星矢 NEXT DIMENSION 冥王神話車田正美※2006年22/23号にプロローグを読切掲載後、不定期連載
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2006年38号~2006年48号魔剣士ZANN大舞キリコ
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2006年39号~2011年19号聖闘士星矢 THE LOST CANVAS 冥王神話漫画:手代木史織、原作:車田正美
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2006年04号~2008年12号白亜紀恐竜奇譚 竜の国のユタ所十三
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2006年42号~2006年49号優駿の門 特別篇 ディープインパクトやまさき拓味※短期集中連載
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2006年05号~2008年52号鉄鍋のジャン!R 頂上作戦西条真二※第1部:2006年05号~2007年17号。第2部:2007年28号~2008年52号
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2006年51号~2007年43号私は加護女漫画:近藤豪志、原作:高橋葉介少年チャンピオン・コミックス:全4巻※2007年08号までは短期集中連載。15号から本格連載化
週刊少年チャンピオン - 2006年
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